2、没有发现生活遗迹
任何一个史前遗迹中，都会有先民的生活遗迹的发现。但在小河墓地的周围甚至十几公里远的地方，考古队经过仔细调查，都没有发现和小河人处在同一时期的生活遗迹。那么，小河人的生活遗迹在哪里呢?
3、木棺像艘船
小河墓地是一种累层叠加的墓葬形式，上下一共五层。木棺像倒扣在岸上的木船，将死者罩在其中，两根胡杨树干被加工成一对比人体稍长一些的“括号”形，这是棺木的侧板，“括号”两头对接在一起，将挡板楔入“括号”状棺板两端的凹槽中固定，没有棺底，棺盖是十多块宽度依棺木弧形而截取的小挡板。
活牛被当场宰杀，立即剥皮，整个棺木被新鲜的牛皮包裹。牛皮在干燥的过程中不断收缩，沙漠中干旱的气候会蒸发牛皮中所有的水份，最后牛皮紧紧地、严密地将棺木包裹。为何这样建造像艘船一样的棺木，考古学家不得其解。
4、河文明的消失之谜
我们看到了小河人的死，却找不到他们生的痕迹。有学者推测，小河也许是一个古代居民们的公共墓地或者是贵族的墓地?人类学家摩尔根说：“世界文化的钥匙遗失在了塔克拉玛干。”探索小河墓地，对罗布泊地区的古人类研究有着特殊的意义。就小河墓地所代表的文明来说，他们的消失是最大的谜团。究竟是沙漠吞噬了这个文明?还是一场瘟疫毁灭了这个文明?又或者是战争?目前，谁也无法解释这个谜团。
